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中外研究人員經(jīng)3年多努力,合作創(chuàng)建了全球首個統(tǒng)一標準的心臟細胞器蛋白質(zhì)圖譜庫,在心臟蛋白質(zhì)組生物信息學研究方面取得重要進展。該研究把心臟生物學基礎研究和臨床心臟醫(yī)學研究兩大領域連為一體,對促進心臟轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究有重要意義。相關論文近日在線發(fā)表在《循環(huán)研究》雜志上。
蛋白質(zhì)是與生命及各種形式的生命活動緊密聯(lián)系在一起的物質(zhì),越來越多的組學技術(基因組學、蛋白質(zhì)組學和代謝組學等)研究在心血管生物領域中已廣泛應用,尤其是科學家在大規(guī)模蛋白質(zhì)組學研究中已發(fā)現(xiàn)許多以前沒有發(fā)現(xiàn)的規(guī)律,有些規(guī)律對解釋心臟細胞在生理或病理狀態(tài)下的運作機制有重要意義。但蛋白質(zhì)組學研究存在標識、對比參照物不統(tǒng)一等問題,而心臟細胞器蛋白質(zhì)圖譜庫的建立將有助于解決這些難題。
該研究由復旦大學附屬中山醫(yī)院特聘教授、美國加州大學洛杉磯分校戴衛(wèi)·格芬醫(yī)學院心臟病學專家平琲琲教授及其研究團隊,與復旦大學附屬中山醫(yī)院心血管病研究所葛均波院士研究團隊及歐洲生物信息學研究所等合作完成。
論文共同第一作者、復旦大學附屬中山醫(yī)院心血管病研究所李華博士介紹,全球首個心臟細胞器蛋白質(zhì)圖譜庫是一個全球共享平臺,具有實時更新數(shù)據(jù)的功能,可將不同學科間的資源進行整理,從而有利于研究人員在特定生物背景下從事蛋白信號通路的深入研究。心臟細胞器蛋白質(zhì)圖譜庫平臺具有三大優(yōu)勢,一是設有很多已經(jīng)整合過的重要數(shù)據(jù),設有專為研究人員設計的寬泛、快速鑒定蛋白的搜索引擎;二是含有一個數(shù)據(jù)庫和一套生物信息工具,可用來整合已知生物醫(yī)學特征(如基因突變及疾病表型等);三是實時在線,有利于研究人員高效分析、上傳和查詢相關數(shù)據(jù)。記者 孫國根